随着深圳经济特区的发展，进出特区的交通工具及其运载的人员、物品等不断递增。二十世纪90年代初期，公路检查站的业务量已经饱和，造成进出特区的候检车辆出现拥挤甚至堵塞现象。为此，在扩建南头、布吉检查站的同时，新设置同乐、梅林两个检查站，1994年同乐检查站建成投入使用，1995年梅林检查站建成投入使用。2001年,溪冲检查站建成投入使用。2005年，清水河检查站成立。2006年，盐排、南坪检查站先后成立。2007年，新区、新城、福龙检查站相继建成。2008年南光检查站建成。至此，深圳经济特区管理线陆地沿途共设有南头、同乐、白芒、梅林、布吉、沙湾、盐田、揹仔角、溪涌、清水河、盐排、南坪、新区、新城、福龙、南光等16个公路道口检查站。