蒙城博物馆的外形方方正正，灰色的砖墙，红色的顶，像青铜礼器方樽和汉阙，里面分地下一层，地上四层，主要陈设《“原始第一村”——尉迟寺遗址》、《古蒙神韵》、《楹联之乡》三大展览版块。 《“原始第一村”——尉迟寺遗址》通过先民安居、原始聚落、墓葬祭祀和发掘记事四个单元介绍了大汶口-龙山文化时期尉迟寺先民的生产生活面貌，可以看到复原后的聚落、围沟、排房、中心广场等场景，以及石器、陶器等尉迟寺出土文物的真迹，其中顶部是一只小鸟的陶器“鸟形神器”是博物馆的镇馆之宝。 《古蒙神韵》主要展览各个时期的文物，介绍蒙城的历史文化。蒙城被称为“中国楹联之乡”，所以单独辟出了一个展厅展览《楹联之乡》，从楹联渊源、中国楹联报和楹联之乡三个方面介绍蒙城的楹联文化。此外，在一楼还设有临时展厅，临时展览内容可详见官网。