中科院水生生物博物馆位于武汉市东湖南岸水生生物研究所内，靠近武汉大学。博物馆前身是淡水鱼类博物馆，自1954年从上海搬到武汉，已有60年历史。博物馆内收藏有丰富的水生生物标本，包含中国淡水鱼类标本一千余种，40余万尾；来自国外34个国家和地区的鱼类标本600余种；藻类标本2万多号；以及各类群的无脊椎动物标本。博物馆的“镇馆之宝”是一头矛尾鱼标本，它是世界上现生的比较古老的鱼类。除此之外，还能看到已经灭绝的白鱀豚标本，还有中华鲟、白鲟、江豚、山瑞鳖、大鲵、胭脂鱼、扬子鳄等水生生物标本，以及丰富的鲤科鱼类和青藏高原鱼类标本等等。