Atotonilco el Alto es una ciudad de la región Ciénega, en el estado mexicano de Jalisco. ​ Culturalmente es parte de los Altos de Jalisco. Se le denomina a esta localidad como La Puerta de los Altos. ​ Fue parte de la Provincia de Nueva Galicia, actual Nayarit y Jalisco, en el Reino de Nueva Galicia entre su fundación y 1786, y de la Intendencia de Guadalajara de 1786 a 1821. ​